Фамилия Крапотухина — женская форма, исходная мужская — Крапотухин. В её основе лежит не имя, а прозвище, и разобраться с ним интереснее, чем кажется на первый взгляд.

Словообразовательная модель проста: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»), то есть Крапотухин — сын или потомок человека по прозвищу Крапотуха. А вот само прозвище неоднозначно. Первое, что приходит в голову, — связь с глаголом «крапать» (капать, идти мелкому дождю, ставить крапины). В говорах «крапотуха» могла означать либо рябую, пёструю вещь или животное (например, курицу с крапинками), либо человека с веснушками или оспинами на лице. Такое прозвище давали по внешнему признаку — рябому, конопатому.

Однако есть и вторая, менее очевидная версия. В некоторых областях «крапотуха» — это название птицы, чаще всего курицы с пёстрым оперением. Прозвища по птицам в крестьянской среде были распространены: их давали за сходство поведения, голоса или внешности. Крапотухой могли прозвать крикливую, суетливую женщину или, напротив, человека в пёстрой одежде.

Регионально фамилия тяготеет к центральным и южнорусским областям — там, где активно бытовали слова с корнем «крап-» (крапина, крапчатый). Встречается она нечасто, что говорит о локальном происхождении прозвища. Сословно — почти наверняка крестьянская или мещанская: прозвища такого типа редко давали дворянам.

В написании стоит обратить внимание на чередование: возможны варианты «Крапатухина» (с буквой «а») — это диалектное произношение, которое могло закрепиться в документах. Но литературная норма — через «о».

Коротко: предки носительницы фамилии, скорее всего, получили прозвище по внешности (рябой, веснушчатый) или по птице, а закрепилось оно в форме Крапотухин, откуда и пошла женская версия.