Фамилия Крепс — редкий для России случай, когда корень уходит не в славянские, а в балтийские языки. Скорее всего, в основе лежит литовское слово krepšys — «сумка» или «корзина». Прозвище Крепс могли дать человеку, который плёл корзины или торговал ими. Такая профессия была распространена в Литве и приграничных с ней русских землях, что объясняет появление фамилии в восточнославянской среде.

Есть и вторая версия — от латышского krēpes («грива»). В этом случае прозвище указывало на внешность: густые, пышные волосы, которые сравнивали с лошадиной гривой. Оба варианта правдоподобны, но литовский корень встречается в ономастических источниках чаще, поскольку модель прозвищ по роду занятий для фамилий типичнее, чем по случайному внешнему признаку.

Фамилия Крепс не имеет типичных русских суффиксов (-ов, -ин, -ский), что прямо указывает на её неславянское происхождение. Встречается она в основном на северо-западе России, в Псковской и Ленинградской областях, а также в Беларуси и Прибалтике. Окончательно определить точное время и место возникновения конкретной ветви Крепсов можно только по генеалогическим документам — записям в метрических книгах или ревизских сказках.