Фамилия Крисенко, как и многие украинские фамилии, образовалась от прозвища. В основе лежит прозвище Крись, и сразу бросается в глаза характерный суффикс -енко, который в украинской ономастике выполняет роль отчества или указателя на принадлежность: «сын Крися» или «потомок Крися». Эта модель была особенно распространена в Поднепровье и на Левобережной Украине в XVI–XVII веках, постепенно вытесняя более архаичные формы.

Что же означало само прозвище Крись? Здесь есть несколько версий, и ни одна из них не является абсолютно бесспорной, но каждая по-своему интересна.

Первая версия отсылает к украинскому слову «криси» — так называли широкие поля у шляпы или загнутые края посуды и лодки. Если следовать этой логике, прозвище Крись мог получить человек, который постоянно носил широкополую шляпу, выделявшую его среди окружающих. Такая деталь внешности — яркая и заметная — часто становилась основой для уличного прозвища.

Вторая версия связывает прозвище со словом «кріс» (ружьё). В этом случае Крись — это именование по роду занятий. Предок мог быть охотником, военным или, что не менее вероятно, мастером-оружейником, изготавливавшим и ремонтировавшим ружья. В условиях казацкой Украины профессия, связанная с оружием, была уважаемой и востребованной, поэтому прозвище легко могло закрепиться за целым родом.

Третья версия, менее распространённая, но имеющая право на существование, предполагает, что Крись — это народная, просторечная форма крестильного имени Кристиан (от греческого «христианин»). В украинской среде иностранные имена часто переделывались на свой лад, и Крись могло стать сокращением от полного имени. Однако эта гипотеза слабее первых двух, так как имя Кристиан было на украинских землях довольно редким по сравнению с Иваном или Петром.

Таким образом, наиболее вероятно, что фамилия Крисенко возникла в среде ремесленников или казаков, а её основа — либо характерная деталь одежды, либо профессиональная принадлежность к оружейному делу.