Фамилия Кристовир — один из тех редких случаев, когда русское по форме окончание скрывает нерусскую основу. Первое, что бросается в глаза: суффикс -ир, абсолютно нехарактерный для исконных русских фамилий. В русской ономастике типичны -ов/-ев, -ин, -ский, -их/-ых. Окончание -ир указывает на западное, скорее всего, немецкое или прибалтийское происхождение. Фамилия могла возникнуть в среде немецких колонистов, переселившихся в Российскую империю в XVIII–XIX веках, или остзейских немцев, живших в Прибалтике.

Основа фамилии — Кристо- — это усечённая форма имени Кристоф (Christoph) или Кристан (Christian). Второй элемент, -вир, сложнее. Возможно, это искажённое немецкое «wir» (мы) или часть более длинной фамилии, которая при русификации сократилась. Есть и другая версия: -вир могло быть вариантом окончания -вирт (Wirt — хозяин, трактирщик). Тогда Кристовир могло означать «хозяин Кристоф» или «Кристоф-трактирщик». В любом случае, перед нами составная фамилия, где первая часть — личное имя, а вторая — прозвище или указание на занятие.

Встречаемость фамилии очень низкая. В дореволюционных метрических книгах и современных справочниках она почти не фиксируется. Это говорит о том, что род был немногочисленным и, вероятно, не относился к крестьянскому сословию — у крестьян фамилии чаще были массовыми, образованными по одной модели. Скорее всего, Кристовиры — это потомки обрусевших немцев, возможно, ремесленников, аптекарей или мелких чиновников, которые жили в городах центральной России или в Поволжье.

Сравнение с однокоренными фамилиями подтверждает западный след. Фамилии Кристоферов, Кристофоров, Кристанов — все они образованы от того же имени, но с русскими суффиксами. Кристовир выделяется именно суффиксом -ир, который не даёт фамилии «обрусеть» до конца. Это редкий случай, когда фамилия сохранила иноземную словообразовательную модель, даже перейдя на кириллицу.