Фамилия Крохалёв образована от мирского имени Крохаль. Нецерковное имя Крохаль восходит к слову «крохаль» — «птица семейства утиных». Давая младенцу такие имена, как Волк, Крохаль, Соловей, Калина, родители хотели, чтобы природа воспринимала ребёнка как своего, чтобы к нему перешли полезные качества, которыми наделён избранный представитель животного или растительного мира. Птица крохаль — нырок с узким клювом, отличный пловец и ныряльщик. В народе считалось, что такое имя передаст ребёнку ловкость и приспособляемость к любой среде.

Согласно другой версии, имя Крохаль связано со словом «кроха». Возможно, что это имя носил младший ребёнок в семье. В русской традиции младшим детям нередко давали прозвища по смыслу «маленький»: Кроха, Крошка, Крохаль. Со временем такое прозвище закреплялось как семейное имя.

Фамилия образована по стандартной модели: к основе Крохаль прибавили патронимический суффикс -ёв, который указывает на принадлежность («чей?» — Крохалёв, то есть сын Крохаля). Ударение падает на последний слог: Крохалёв. В дореволюционных документах встречается написание через «е» — Крохалев, но современная литературная норма фиксирует форму с «ё».

Интересно, что фамилия Крохалёв встречается в основном в северных и центральных регионах России — в Вологодской, Архангельской, Костромской областях. Это совпадает с ареалом обитания птицы крохаль, которая гнездится на севере Евразии. Возможно, первые носители фамилии жили в местах, где эта птица была хорошо известна, и имя давали по окружающей природе.

Таким образом, потомок человека по имени Крохаль со временем получил фамилию Крохалёв. Какая из двух версий — птичья или «крошечная» — верна для конкретной семьи, сегодня установить сложно. Но обе они укладываются в древнюю традицию давать детям имена-обереги от окружающего мира.