Фамилия Круган — редкий случай, когда основа, скорее всего, не русская, а польская или западнославянская. В польском языке слово «krugan» означает «крыльцо», «галерея» или «паперть» — архитектурный элемент, пристройку к зданию. Человек, живший рядом с такой постройкой или работавший при ней, мог получить прозвище Круган. Есть и другая версия: в некоторых говорах так называли круглый, замкнутый двор или хозяйственный двор-крепость.

По словообразовательной модели фамилия стоит особняком. В ней нет типичного русского суффикса (-ов, -ин, -ский), который присоединял бы прозвище к отчеству. Круган — это «чистая» основа, усечённая форма, которая закрепилась как фамилия без дополнительных оформлений. В России такие бессуффиксные фамилии чаще встречаются среди украинцев и белорусов, а также у выходцев из Речи Посполитой, переселившихся в центральные губернии.

Не исключено, что фамилия имеет топонимическое происхождение. В Польше и Западной Беларуси есть несколько деревень с названием Круганы или Круган. В таком случае предок носителя фамилии был выходцем из этого села, и его прозвали по месту жительства. Поскольку фамилия не массовая, а редкая, её география, скорее всего, привязана к западным областям бывшей Российской империи.

Сравните с однокоренными фамилиями: Круганов, Круганин, Круганский. Первые две явно русифицированы — добавлен суффикс принадлежности. А вот Круган без суффикса — более старый, архаичный вариант, который мог сохраниться у тех, кто не попал под позднюю канцелярскую унификацию фамилий в XIX веке.