Основой фамилии Крякушина послужило мирское имя Крякуша. Мирское имя Крякуша восходит к аналогичному названию птицы, которое является диалектным названием кряквы - птицы из семейства утиных отряда гусеобразных; от нее произошла обыкновенная домашняя утка. Давая младенцу такое имя, как Крякуша, родители хотели, чтобы природа воспринимала ребенка как своего, чтобы к нему перешли те полезные качества, которыми наделено это животное или растение. Также возможно, что фамилия Крякушина образована не от имени, а от прозвища Крякуша, которое восходит к глаголу «крякать», то есть «трещать, хрустеть, ломаться, раздаваться с треском, кряхтеть или стонать, негромко охать; кричать по-утиному». Таким образом, возможно, что прозвище Крякуша дали человеку, который мастерски мог подражать утиному кряканью, или охотнику, который манил уток. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Крякуша, со временем получил фамилию Крякушин.