Фамилию Крюченка стоит разбирать не по привычной модели «основа + суффикс», а с другого конца — с её окончания. Финальное -а в русских фамилиях обычно указывает на украинское или белорусское происхождение. В украинском языке суффикс -енк-о (с ударением на последний слог) образует фамилии от имени или прозвища отца: Крюк → Крюченко, то есть «сын Крюка». Форма Крюченка — это русифицированный или диалектный вариант той же модели, где окончание -о заменили на -а, подстроив под грамматику русского языка. Такое встречалось при переносе фамилий в официальные документы, особенно в южнорусских губерниях.

Основа фамилии — прозвище Крюк. В восточнославянской традиции Крюком могли назвать человека с характерной внешностью: сгорбленного, с крючковатым носом или цепкими руками. Но чаще прозвище давали по занятию. Крюк — инструмент, которым пользовались многие ремесленники: кузнецы для подъёма тяжестей, рыбаки для вытаскивания сетей, бондари для стягивания бочек. В словаре Даля «крюк» — это ещё и «цепкий человек», прижимистый. Так что предок носителя фамилии мог быть либо мастеровым человеком с характерным орудием труда, либо человеком с неуступчивым, «крючковатым» характером.

В отличие от более распространённой фамилии Крюков, где суффикс -ов прямо указывает на принадлежность (чей сын? — Крюков), форма Крюченка сохранила живую уменьшительную окраску. Это не просто «сын Крюка», а скорее «маленький Крюк» или «Крючонок». Такая модель часто закреплялась за младшим сыном в семье или за человеком, который унаследовал прозвище от отца, но уже в более мягком, бытовом варианте.

Географически фамилия тяготеет к левобережной Украине и югу России — Черниговская, Полтавская, Курская губернии. В современных российских архивах Крюченка встречается реже, чем Крюченко, но именно эта форма с конечным -а может говорить о том, что предки давно обрусели и фамилия прошла через канцелярию XIX века, где писари переделывали «неудобное» украинское -о на привычное -а.

Спорных версий у фамилии немного. Иногда её пытаются связать с глаголом «крючить» — сводить судорогой, но это натяжка: прозвища от глаголов в такой модели не образуются. Куда правдоподобнее, что перед нами типичная украинская фамилия на -енко, которая при миграции на север и восток потеряла своё окончание и стала звучать как Крюченка.