Фамилия Крыженков — одна из тех, что хранят память о прозвище, данном, скорее всего, как оберег. В её основе лежит древнее слово «крыж», которое у западных, восточных и южных славян означало «крест»: вспомните польское krzyz, чешское křiž, украинское «криж» или сербохорватское «криж». Само слово «крыж» исследователи, включая Фасмера, возводят к романскому корню croge (звучало примерно как «крож»), которое бытовало на территории Аквилеи и Венеции. Появление гласного «и» лингвисты Миккола, Мейе и Мейе-Вайан объясняют влиянием твёрдого согласного «р».

Прозвища, связанные с крестом, в древности считались особыми. Крест — один из древнейших сакральных знаков, главный символ христианства, монограмма имени Христа. В традиционной культуре славян крестом отмечали сакральные и опасные места: поляки чертили его ножом на каравае хлеба перед разрезанием, восточные и западные славяне на Крещение выводили крест дымом на дверных притолоках. У южных славян крест ставили рядом с почитаемым деревом или вырезали на нём, а также изображали на надгробиях, прялках и пасхальных яйцах. Вполне вероятно, что прозвище Крыж дали ребёнку как оберег: надеясь, что он вырастет благовоспитанным и отзывчивым, родители как бы «закрепляли» за ним защитную силу креста.

Фамилия Крыженков, судя по суффиксу -енко, первоначально возникла на территории Белоруссии. Там она имела форму Крыженко. Со временем, когда род перебрался в Россию, фамилия русифицировалась — к основе добавили суффикс -ов, и она приобрела привычное нам окончание. Среди носителей фамилии есть участники Великой Отечественной войны, например, Крыженков Андрей Павлович 1922 и 1924 годов рождения.