Фамилия Ксенакис — одна из тех, что сразу выдают географическое и языковое происхождение носителя. Это греческая фамилия, и её разбор стоит начать не с корня, а с суффикса, который является ключевым маркером. Окончание -ис (в оригинале -ης) — типичный патронимический суффикс новогреческого языка, соответствующий русскому -ов/-ев или -ин. Он указывает на принадлежность: «сын такого-то» или «из рода такого-то». Таким образом, Ксенакис буквально означает «сын Ксенака» или «потомок Ксенака».

Основа фамилии — имя Ксенакас (Ξενάκας). Это, в свою очередь, уменьшительная или производная форма от имени Ксенос (Ξένος). В древнегреческом языке ξένος означает «чужой», «чужеземец», «гость» или «наёмник». Однако в византийский и новогреческий период это слово вошло в состав личных имён, часто как прозвище для пришлого человека или для того, кто много путешествовал. Имя Ксенос было не самым распространённым, но встречалось, особенно на островах и в прибрежных регионах, где контакты с иноземцами были обычным делом.

Модель образования «имя + уменьшительный суффикс -ак- + патронимический -ис» очень продуктивна для греческих фамилий. Сравните: Пападакис (от папас — поп), Канакис (от Кана — Хан), Мавроматис (чёрный глаз). Суффикс -ак- придаёт основе оттенок «маленький» или «младший», поэтому Ксенакас — это, скорее всего, «маленький Ксенос» или «младший из чужаков». Фамилия Ксенакис, таким образом, могла закрепиться за потомками человека, которого в своё время прозвали Чужеземцем или Гостем, но уже через поколение это прозвище стало родовым именем.

Географически фамилия Ксенакис наиболее характерна для Крита и островов Эгейского моря, где суффикс -akis является доминирующим в фамилиях. В материковой Греции чаще встречаются окончания -пулос, -идис или -оглу. Социальный контекст: в отличие от многих русских фамилий, греческие фамилии на -akis не указывают на дворянское или крестьянское происхождение — это массовая модель, охватившая все слои населения в XIX веке, когда фамилии стали обязательными. Предки носителя фамилии Ксенакис могли быть кем угодно: от моряка до земледельца, но их общий предок, вероятно, выделялся среди местных как «чужак» или «приезжий».

Спорных версий у этой фамилии немного. Иногда её пытаются связать с греческим словом ξενικός («иностранный», «гостеприимный») или с именем Ксенофонт (Ξενοφῶν — «несущий чужую речь»), но это натяжка: суффикс -ак- не характерен для образования от полных имён на -фонт. Правдоподобнее всего версия с прозвищным именем от ξένος. Самый известный носитель фамилии — композитор и архитектор Янис Ксенакис (1922–2001), чьё происхождение с острова Эвбея подтверждает греческий и островной характер фамилии.