Фамилия Кубяк чаще всего ведет происхождение от польского уменьшительного имени Кубяк, которое, в свою очередь, является производной формой библейского имени Иаков (Якуб). В переводе с древнееврейского оно означает «второй по рождению». Изначально такое имя служило домашним, внутрисемейным прозвищем, а затем закрепилось за потомками в качестве фамилии. Именно польская огласовка — Кубяк, а не Кубаков или Кубин — указывает на западнорусские или белорусские корни рода.

Географически фамилия прочно привязана к историческим губерниям: в документах встречаются записи о жительницах Брестской и Пинской губерний — Алине Степановне Кубяк (1932 г.р.), Анюте Ивановне Кубяк (1925 г.р.) и Брониславе Войтиховне Кубяк (1895 г.р.). Эти записи подтверждают, что фамилия была распространена на территории современной Беларуси и восточной Польши, где суффикс -як (-ак) типичен для прозвищ и фамилий.

Наиболее известный носитель фамилии — советский государственный и партийный деятель Николай Афанасьевич Кубяк. Его биография показывает, что фамилия не была исключительно крестьянской или мещанской: встречалась и в среде выдвиженцев первой половины XX века. Однако массовый характер фамилия носила именно среди сельского населения западных губерний Российской империи.

Словообразовательная модель здесь прозрачна: основа Кубяк- (от польск. Kubiak — уменьшительное от Jakub) без дополнительного патронимического суффикса. Такие бессуффиксные фамилии в славянской традиции характерны для прозвищ, которые не успели обрасти типичными русскими окончаниями -ов или -ин, что еще раз указывает на польско-белорусское происхождение.