Фамилия Кучинин образована по одной из самых распространённых в русском языке моделей — с помощью суффикса -ин. Этот суффикс, как правило, указывает на принадлежность: Кучинин буквально означает «чей?» — «сын Кучины» или «потомок Кучины». В основе фамилии лежит прозвище или нецерковное имя Кучина, которое, в свою очередь, образовано от слова «куча».

Значение прозвища могло быть разным. В народной речи «куча» — это не только груда сыпучего, но и толпа, сборище людей, а также большая семья (вспомните выражение «куча мала»). Соответственно, Кучиной могли прозвать либо человека плотного телосложения, либо того, кто жил в многодетной семье, либо просто общительного, «кучного» человека. В некоторых говорах «куча» означала также стог сена или соломы, так что нельзя исключать и связь с сельскохозяйственной работой — например, сенокосом.

Интересно, что фамилии с корнем «куч-» встречаются не только у русских, но и у других славянских народов (украинские Кучин, Кучиненко, польские Kuczyński), что лишний раз подтверждает древность и распространённость этого прозвищного имени. У восточных славян такие именования были особенно популярны в XV–XVII веках, когда фамилии только начинали закрепляться за родами.

Суффикс -ин в фамилии Кучинин (а не -ов) указывает на то, что основа прозвища Кучина оканчивалась на -а. Это характерно для северных и центральных регионов России, где патронимические фамилии на -ин встречаются чаще, чем на юге. Таким образом, географически корни фамилии, скорее всего, лежат в северных или среднерусских землях.

Несмотря на кажущуюся простоту, у фамилии есть и альтернативная, менее вероятная версия происхождения: от канонического имени Никита через его уменьшительную форму Микита, которая в некоторых говорах могла трансформироваться в «Кучита» или «Кучиня». Однако эта гипотеза сложна и не находит прямой поддержки в ономастических словарях. Основной и самой правдоподобной остаётся версия от прозвища Кучина, связанного со словом «куча».