Фамилия Кудырко — яркий пример украинской модели фамилий на -ко, которые в XVI–XVII веках были особенно распространены на Левобережной и Правобережной Украине. Суффикс -ко в украинской ономастике выполнял функцию, близкую к уменьшительной или патронимической, но в фамилиях он часто закреплялся за прозвищами, указывая на связь с носителем исходного имени или качества. В русском языке такие фамилии нередко обрусевали, меняя ударение или окончание, но Кудырко сохранило свою украинскую огласовку.

Основа фамилии — «кудыр» или «кудир». Самая вероятная версия связывает её с диалектным украинским словом «кудир» — вихор, клок волос, торчащий в разные стороны. Прозвище Кудырь или Кудырко могли дать человеку с непослушными, всклокоченными волосами. В славянской традиции такие прозвища были распространены: достаточно вспомнить фамилии Кудрявцев, Кудрин, Кудряшов. Отличие Кудырко в том, что здесь подчёркивается не кудрявость как красота, а скорее взлохмаченность, неряшливость причёски — типичное бытовое прозвище.

Менее убедительна, но возможна версия от тюркского корня, например от «кудыр» (в некоторых тюркских языках — «сильный, могучий»). Украинские степи и Запорожье были зоной активных контактов с тюрками, и фамилии с такой основой встречаются, но для Кудырко эта гипотеза слабее: слово «кудыр» в значении «вихор» имеет прямые параллели в восточнославянских говорах, и объяснять фамилию через тюркское заимствование нет необходимости.

Географически фамилия Кудырко тяготеет к центральным и северным областям Украины: Черкасской, Киевской, Полтавской. В России она редка и встречается в основном в регионах, куда переселялись украинцы в XVIII–XIX веках — на Кубани, в Воронежской области, на Дону. В польских источниках фамилия не фиксируется, что подтверждает её исключительно восточнославянское происхождение.

Сословно фамилия не аристократическая: Кудырко — типичное казацкое или крестьянское прозвище, которое закрепилось в реестрах Войска Запорожского или в метрических книгах сельских приходов. Суффикс -ко в украинской среде был настолько массовым, что не даёт указания на социальный статус — его носили и рядовые казаки, и мещане, и крестьяне. Сейчас фамилия остаётся характерной для потомков украинского населения, сохранивших память о прозвище предка, который, вероятно, выделялся своей шевелюрой.