Фамилия Куксиков — наглядный пример того, как прозвище, данное человеку за характер или привычку, закрепилось в родовом имени. В её основе лежит глагол «кукситься» — хмуриться, быть в плохом настроении, плакать или капризничать. В русских говорах слово «кукса» означало плаксу, нытика, а также человека с кислым, недовольным выражением лица. Таким образом, родоначальник Куксиковых получил прозвище Кукса, которое затем превратилось в фамилию через стандартный патронимический суффикс -ов, указывающий на принадлежность: «сын Куксы».

Интересно, что у слова «кукса» есть и другое, менее распространённое значение — так в некоторых областях называли беспалую руку или культю. В этом случае прозвище могло быть связано с физическим недостатком, а не с характером. Однако первая версия — от глагола «кукситься» — более вероятна и широко представлена в русской ономастике: фамилия Куксин, например, встречается чаще и имеет ту же основу.

Суффикс -ик- в фамилии Куксиков не является типичным для русских фамилий — обычно он встречается в уменьшительно-ласкательных формах имён (Васик, Петрик) или в прозвищах. Здесь же он, скорее всего, входил в состав исходного прозвища Куксик — то есть «маленький Кукса» или «сын Куксы», что делает фамилию трёхступенчатой: Кукса → Куксик → Куксиков. Подобная модель редка, но не уникальна — ср. фамилии вроде Кузькин или Васькин, где суффикс -ин сливается с основой.

Географически фамилия Куксиков тяготеет к центральным и северным регионам России — в переписях XVII–XVIII веков носители прозвища Кукса встречаются в Вологодской и Костромской губерниях. Среди дворянства фамилия не зафиксирована; её обладатели, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми, получившими фамилию после отмены крепостного права.

В словаре русских фамилий Б. Унбегауна фамилия Куксиков не выделена отдельно, но разобрана в ряду однокоренных — Куксин, Куксов. Все они восходят к одному и тому же прозвищному гнезду, что подтверждает народное происхождение фамилии без книжных или церковных корней.