Фамилия Кулебины, как и её более распространённый вариант Кулебин, происходит от прозвища Кулеба. В его основе лежит украинское слово «кулеба» — так называли густой суп, чаще всего из пшена. Первое, что приходит на ум: такое прозвище могли дать любителю плотно и сытно поесть или же искусному повару, который умел приготовить наваристую похлёбку.

Однако у этого корня есть и другая, менее очевидная версия. В нижегородских говорах бытовал глагол «кулебячить» — «валять руками, сваливать, мять, гнуть и складывать, стряпать и лепить». Если вспомнить, что «кулебяка» — это пирог с начинкой, который именно лепят и складывают, то связь становится прозрачной. В таком случае Кулебой могли прозвать не едока, а ремесленника — пекаря или стряпуху, которые постоянно работали с тестом.

Фамилия Кулебин зафиксирована в документах. Например, в Книге памяти Ленинградской области упоминается разнорабочий Иван Николаевич Кулебин, 1881 года рождения, из деревни Ситня Солецкого района. Среди известных носителей — белорусский тайбоксер Андрей Кулебин, девятикратный чемпион мира.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Кулебин — это «сын Кулебы» или «человек из рода Кулебы». Такая модель образования типична для русских фамилий, образованных от прозвищ или имён, оканчивающихся на -а. Окончательно определить, в какой именно местности и в какое время возникла конкретная ветвь Кулебиных, можно только после углублённого генеалогического поиска — слишком много вариантов прозвища и слишком разная география его бытования.