Фамилия Куненов — яркий пример того, как по суффиксу можно почти безошибочно определить географию её происхождения. Суффикс -ов указывает на русскую модель образования, но сама основа фамилии явно не славянская. Всё дело в том, что перед нами — обрусевшая фамилия тюркского корня, которая прошла через стандартную для Российской империи процедуру: к местному имени или прозвищу добавили русский патронимический суффикс, означающий «чей?», «сын кого?». Так кочевники и крещёные инородцы получали фамилии, которые звучали по-русски, но хранили родовую память.

Основа «Кунен» восходит к тюркскому слову «кюн» или «кун» — «солнце», «день», «свет». В казахском, башкирском, татарском и других тюркских языках это одно из самых древних и уважаемых понятий. Имя Кунен (или Кунан) могло даваться ребёнку как оберег — чтобы его жизнь была светлой, как солнечный день. Встречается и другая версия: «кун» в значении «род», «племя» (например, у древних тюрок слово «кун» обозначало подчинённый род). В этом случае Кунен — указание на родовую принадлежность, на человека из определённого клана.

Среди казахов и башкир имя Кунан известно, а фамилия Куненов встречается прежде всего в Оренбургской, Челябинской областях, в Башкортостане и в северных районах Казахстана. Это регионы, где шёл интенсивный процесс русификации местного населения в XVIII–XIX веках: при переписях или при записи в казачье сословие тюркские имена превращали в фамилии с русскими окончаниями.

Интересная деталь: в русском языке фамилия Куненов могла бы быть образована и от прозвища Куня (уменьшительное от Кузьма или Кондрат), но в этом случае мы бы ожидали форму Кунин. Суффикс -енов, а не -ин, — сильный аргумент в пользу тюркской, а не русской основы. Модель «Кунен + ов» чужда славянской антропонимике: в ней нет уменьшительного суффикса -ен- (как в «Котёнок»), а есть цельное имя Кунен, к которому приставили фамильный суффикс. Такая конструкция типична для фамилий, возникших при адаптации нерусских имён.

Если ваш предок носил фамилию Куненов, то, скорее всего, он происходил из среды, где тюркские имена были нормой, а русская фамилия появилась в документах не раньше середины XIX века. Возможно, он был казаком-старожилом на Оренбургской линии или крестьянином-переселенцем, чей род шёл из степных областей.