Фамилия Куниченко — яркий пример украинской модели образования фамилий на -енко. В украинской ономастике этот суффикс исторически выполнял роль отчества или указания на принадлежность к роду: буквально «маленький», «сын» или «потомок» того, кто назван в корне. В данном случае корень — Кунич-, который сам по себе является производным. Первый вопрос, который встаёт перед исследователем: от какого слова образована основа Кунич?

Здесь возможны два основных пути, и оба ведут к прозвищам. Первый и самый вероятный — от слова «куница». В древнерусском и украинском языках это был не только ценный пушной зверь, но и ходовая денежная единица. Прозвище Куница могли дать либо ловкому, юркому человеку, либо тому, кто промышлял пушниной — охотнику или торговцу мехами. Второй путь — от личного имени, точнее, от его уменьшительной формы. В старину было распространено крестильное имя Никита (в народной форме Микита). Его уменьшительные варианты — Микула, Микулка, а также Куня, Кунята. От Куни образовалось отчество Кунич, которое затем и легло в основу фамилии. Таким образом, Куниченко мог означать «внук или сын Куни», то есть потомок некоего Куни, который в свою очередь был Никитой.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то в русской среде чаще встречается вариант Куницын (с суффиксом -ын, указывающим на прямую принадлежность: «чей?» — Куницын). Куниченко же — южнорусский и украинский вариант, где суффикс -енко переводит то же самое значение в форму родовой фамилии. Встречается также фамилия Куничев — она может быть как русским аналогом (суффикс -ев от основы Кунич), так и результатом упрощения исходной формы Куниченко при русификации.

Географически фамилия Куниченко наиболее плотно представлена на востоке Украины, в частности в Сумской, Полтавской и Харьковской областях, а также в приграничных регионах России — Белгородской и Курской областях. Это указывает на её корни в среде украинского казачества и крестьянства Слобожанщины. В сословном отношении носители фамилии относились к казакам и государственным крестьянам, так как украинские фамилии на -енко в массе своей не были дворянскими и закрепились в среде свободного сельского населения.

Таким образом, если вы носите фамилию Куниченко, ваш предок с высокой вероятностью был жителем южнорусских или украинских земель, а его прозвище или имя отца восходит к словам «куница» или «Куня» (Никита). Точнее определить, какой из двух корней сработал в конкретном случае, можно только по ранним документам, но оба варианта одинаково правдоподобны и укладываются в типичную картину бытования фамилии.