Фамилия Куньский — редкий пример фамилии, образованной от топонима, но с неочевидным корнем. В отличие от массовых Павловских или Ивановских, она не отсылает к имени основателя, а почти наверняка связана с названием населённого пункта — Куня, Кунье, Кунь или Куны. Такие «географические» фамилии давали либо переселенцам, переехавшим из этого места, либо помещикам, владевшим землёй в той местности.

Словообразовательная модель прозрачна: суффикс -ск- (в форме прилагательного -ский) указывает на принадлежность к чему-либо. Куньский — «тот, кто родом из Куни». В польской и западнорусской традиции такие фамилии на -ский были особенно характерны для шляхты и духовенства, но в XIX веке их могли получить и крестьяне при переписях — по месту жительства.

Корень «кунь» в славянских языках многозначен. Самое очевидное — «куница», пушной зверёк. Но топонимы Кунья, Кунь, Куня встречаются в Псковской, Новгородской, Тверской областях, а также в Беларуси и Польше. Есть версия, что название реки Кунья происходит от финно-угорского «кун» — «медведь», но для фамилии это уже вторично. Спорных гипотез немного: пытаться вывести Куньского напрямую от прозвища Куня (например, от слова «кунь» в значении «хитрый, как куница») можно, но менее правдоподобно — тогда ожидалась бы форма Кунин или Кунев, а не Куньский.

Написание фамилии может варьироваться: Кунский (без мягкого знака) — тоже встречается, но это уже другой корень, возможно, от слова «кун» (денежная единица в Древней Руси). В польском варианте фамилия звучала бы как Kuński, что подтверждает её западнославянские или литовско-польские корни. Если предки носителя фамилии были из бывшей Речи Посполитой, то Куньский мог принадлежать к мелкой шляхте, осевшей на восточных окраинах.

География бытования фамилии сегодня — в основном Россия (Псковская, Ленинградская области) и Беларусь, единичные случаи в Польше и на Украине. Носителей немного, что делает фамилию локальной и ценной для генеалогического поиска: если вы Куньский, то почти наверняка ваша родовая история привязана к конкретному селу или усадьбе с похожим названием.