Фамилия Купчищина — редкий случай, когда основа не вызывает споров, а вот суффикс требует внимания. Корень здесь очевиден: «купч-» от слова «купец» или «купчина» (устаревшее, народное обозначение купца). Но почему не Купчин или Купчинов, а именно Купчищина? Всё дело в модели образования, характерной для северных и сибирских говоров.

Суффикс «-щин» (в женском роде «-щина») в русских фамилиях встречается нечасто. Обычно он указывает на принадлежность к месту или роду: «мы из Купчищина» — то есть из семьи Купчи. По сути, это притяжательная форма, отвечающая на вопрос «чей?». В отличие от стандартного «-ов» (Купцов) или «-ин» (Купчин), суффикс «-щин» закрепился в основном в северорусских землях — в Архангельской, Вологодской, Вятской губерниях. Там же, кстати, встречаются фамилии вроде Ситщина, Глазщина, образованные по той же модели.

Вторая версия, менее вероятная, но допустимая: фамилия могла произойти от прозвища «Купчище» — так в насмешку или с уважением называли крупного, богатого торговца, «большого купца». Суффикс «-ищ» в русском языке имеет увеличительное значение (ср. «домище», «холодище»). Тогда Купчищин — это сын Купчища, а Купчищина — женская форма от той же основы. Однако на практике фамилии на «-ищин» встречаются реже, чем на «-щин», и чаще фиксируются в документах как Купчищин, а не Купчищина.

В современных справочниках фамилия Купчищина не относится к частотным. Её носители, судя по открытым данным, рассеяны по центральной России и Уралу, но не образуют плотных гнёзд. Это подтверждает версию о локальном происхождении: фамилия могла возникнуть в одной деревне или волости, а затем разойтись с переселенцами.

Ономастический словарь Бориса Унбегауна прямо не разбирает этот вариант, но его классификация суффиксов (так называемые «фамилии на -их, -ых» и близкие к ним формы) позволяет уверенно отнести Купчищину к типу «патронимов с северным суффиксом». Иными словами, предок носителя этой фамилии был, скорее всего, либо самим купцом, либо человеком, получившим прозвище за связь с торговлей — и жил он в краях, где говорили не «Купчинов», а «Купчищин».