Фамилия Кушиничев — редкая и по-своему загадочная. Она образована по модели, типичной для русского Севера, Поволжья и некоторых областей Сибири: суффикс -ев присоединён к основе, оканчивающейся на мягкий согласный. Но главная трудность — в корне. В русском языке нет общеупотребительного слова «кушина» или «кушиня», которое прямо объясняло бы прозвище. Поэтому приходится искать среди диалектов и заимствований.

Наиболее правдоподобная версия — связь с диалектным словом «кушня» или «кушаня». В говорах Вологодчины и Архангельской области так называли нечто маленькое, невзрачное, а иногда — закуток или тесное помещение. Прозвище Кушиня могли дать либо невысокому и щуплому человеку, либо тому, кто жил в тесноте, в «кушне». В таком случае Кушиничев — «сын Кушини», то есть потомок человека с прозвищем Кушиня.

Есть ещё одна версия, менее вероятная, но не лишённая оснований. В тюркских языках (особенно в татарском и башкирском) слово «куш» означает «пара» или «двойня», а «кушын» — «соединение». Фамилия могла возникнуть на стыке русской и тюркской культур, например, в Казанской или Уфимской губерниях. Прозвище Кушиня могло получить двоякое объяснение: либо ребёнок родился одним из двойни, либо человек был «соединителем» — миротворцем или сватом. Однако суффикс -иничев (а не, скажем, -ов) указывает скорее на русскую, а не на татарскую среду, поэтому тюркская версия остаётся вторичной.

География фамилии подтверждает северное происхождение. Кушиничевы встречаются в основном в Кировской области, в Пермском крае и в Удмуртии — то есть в зоне позднего заселения русскими выходцами с Вятки и Северной Двины. Это косвенно говорит о том, что предки Кушиничевых были государственными или монастырскими крестьянами, осваивавшими новые земли в XVII–XVIII веках.

Интересная деталь: в старых метрических книгах фамилию могли записывать через «а» — Кушаничев. Такое написание встречается в документах по Сарапульскому уезду Вятской губернии. Это не ошибка, а отражение местного произношения: в северных говорах «о» после мягких согласных часто переходило в «а» (так называемое яканье). Поэтому Кушиничев и Кушаничев — фактически одна и та же фамилия, разошедшаяся в написании из-за разных канцелярских традиций.

Таким образом, Кушиничев — фамилия, скорее всего, прозвищного происхождения, связанная с внешностью или бытовыми условиями предка. Её носители — потомки крестьян Русского Севера и Приуралья, а редкое окончание -иничев (вместо более распространённого -ин) делает её заметной даже среди однокоренных фамилий.