Фамилия Кутынин — одна из тех, где простота звучания обманчива. На первый взгляд кажется, что в основе лежит что-то «кутное» или «кутаное», но лингвисты видят здесь другой, более конкретный корень. Самая вероятная версия отсылает нас к слову «кутырь» — так в южнорусских и украинских говорах называли кожаный мешок или сумку, а в переносном смысле — пузатого, толстого человека или того, кто носит с собой много вещей. Прозвище Кутырь мог получить либо дородный мужчина, либо, наоборот, запасливый хозяин, либо ремесленник, работавший с кожей. От этого прозвища с помощью суффикса -ин и образовалась фамилия Кутынин, то есть «сын Кутыря».

Менее распространённая, но тоже возможная версия — связь с диалектным глаголом «кутать» (укутывать, прятать). В этом случае прозвище Кутыня могли дать человеку, который кутался в одежду, либо тому, кто работал с тканью или валял валенки. Однако суффикс -ын в фамилии Кутынин указывает на основу на -а/-я, что лучше сочетается с «Кутыня», чем с «Кутырь». Тем не менее, вариант с «кутырем» считается более убедительным в ономастике, так как слово «кутырь» фиксируется в исторических документах чаще, чем прозвище Кутыня.

Фамилия довольно редкая. Её география тяготеет к югу России и Поволжью — там, где были распространены говоры с этим словом. Встречается она и на Урале, куда переселенцы принесли прозвище с собой. Сословной привязки нет: Кутынины могли быть и крестьянами, и мещанами, и казаками — прозвище бытовало в разных средах. Интересно, что фамилия сохранила старую модель образования без наращения -ов-: не Кутырев, а Кутынин, что говорит о её давнем происхождении, когда суффикс -ин присоединялся напрямую к основе прозвища.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Кутырёв и Кутырин образованы от того же корня, но с разными суффиксами. Кутынин стоит в этом ряду особняком, подчёркивая, что родоначальника звали именно Кутыня или Кутырь, а не, скажем, Кутыра. В любом случае, предок нынешних Кутыниных был человеком с яркой внешностью или характером — либо заметным брюхом, либо приметной привычкой таскать с собой мешок.