Фамилия Кужахметова — женская форма, а её мужской вариант — Кужахметов. Это типичная для тюркских народов фамилия, образованная от личного имени. В её основе лежит сложное имя Кужахмет, которое восходит к двум арабским корням: «кужа» (искажённое «кожа», «ходжа» — господин, хозяин, наставник) и «ахмет» (одна из форм имени Ахмад, «достохвальный»). Таким образом, имя Кужахмет можно перевести как «господин Ахмет» или «почтенный Ахмет». Это имя давали в честь уважаемого предка или религиозного деятеля, подчёркивая его статус и благочестие.

Фамилия распространена среди народов, исповедующих ислам, особенно у башкир, татар и казахов. Суффиксы -ов/-ев в таких фамилиях — результат русификации в XIX–XX веках, когда в документах тюркские имена и прозвища адаптировали под русскую грамматику. В исходной, нерусифицированной форме у башкир и татар фамилия могла звучать как Кужахметов, а у казахов — как Кужахметов или Кожаахметов.

Интересная деталь: основа «кожа» или «кужа» в тюркских языках часто указывала на принадлежность к духовному сословию или на происхождение от пророка Мухаммеда (так называемые ходжи). Поэтому предки носителей фамилии Кужахметова могли быть муллами, учителями или просто уважаемыми старейшинами в своей общине. Однако не стоит исключать и вариант, что имя было дано как пожелательное — чтобы ребёнок вырос мудрым и уважаемым, как ходжа.

С географической точки зрения фамилия встречается в Башкортостане, Татарстане, Оренбургской и Челябинской областях, а также в Казахстане. Встречаемость невысокая, что делает её довольно редкой. Однофамильцы, скорее всего, связаны отдалённым родством, так как фамилия произошла от конкретного имени, а не от массового прозвища.

В дореволюционных документах фамилию могли записывать по-разному: Кужахметов, Кожахметов, Кожа-Ахметов. Вариативность объясняется разницей в произношении в разных диалектах и неграмотностью писарей. Современное написание «Кужахметова» закрепилось в советский период при паспортизации.