Фамилия Кужильская — редкий пример, где географическая привязка почти наверняка перевешивает прозвищную или профессиональную версию. В отличие от массовых фамилий на -ов/-ев, эта форма указывает на происхождение от конкретного места: села, деревни или усадьбы с названием Кужиль, Кужили или Кужилево. Суффикс -ск- (в женском роде -ская) — классический маркер дворянских и шляхетских фамилий в Речи Посполитой, но в XIX веке его активно присваивали и крестьянам, и мещанам при переходе от прозвищ к официальным фамилиям. Так что Кужильская могла быть и у польской шляхты, и у белорусских или украинских крестьян, которых записывали «по имению».

Основа «Кужиль» неочевидна. Самый вероятный корень — диалектное «кужиль», вариант «кудель»: пучок льна или шерсти для прядения. В польском языке есть слово «kudły» (космы, спутанные волосы) и «kędzior» (кудри). Если фамилия пошла от прозвища Кужиль, его давали либо человеку с лохматыми волосами, либо, что реже, прядильщику-кудельнику. Но для фамилии на -ский такая бытовая основа нетипична — обычно прозвища давали суффиксы -ов/-ев. Поэтому реалистичнее считать, что прозвище Кужиль стало названием деревни, а уже от неё образовалась фамилия.

Вторая версия — литовский след. В Литве есть фамилия Kuželys (Кужелис), а в белорусских говорах встречается слово «кужэль» (моток ниток). На территории бывшего Великого княжества Литовского, особенно в Гродненской и Витебской губерниях, фамилии на -ский нередко возникали от балтских топонимов. Если допустить, что исходное «Кужиль» — искажённое «Кужель» (от лит. kuželis — «мотылек» или «прядка»), то фамилия могла появиться в пограничных районах, где смешивались языки.

Ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог: Кужи́льская. Встречаются варианты написания с одной «л» (Кужиская) или через «ы» (Кужильския) — это следы старой орфографии до реформы 1918 года. Поскольку фамилия редкая, её носители, вероятно, сосредоточены в западных регионах Беларуси, на востоке Польши и в Литве, а также в среде потомков эмигрантов первой волны. Точных данных о дворянском происхождении нет, но сама модель фамилии не исключает, что предки Кужильских владели небольшим хутором или фольварком с названием Кужили.