Фамилия Кыркунов — одна из тех, где на слух угадывается тюркский след, но корень неочевиден. Основу «Кыркун» можно разобрать по-разному, и в этом её интерес.

Вероятнее всего, в основе лежит тюркское слово «кырк» — «сорок», к которому добавился аффикс -ун, образующий имя или прозвище. Тогда Кыркун — буквально «сороковой» (например, сороковой ребёнок в семье, что в многодетных тюркских семьях было делом обычным и давало имя по счёту). Менее вероятна, но возможна связь с глаголом «кырк-» (резать, стричь), тогда прозвище могло относиться к тому, кто стрижёт овец или режет скот.

Суффикс -ов в фамилии стандартный для русского языка, он указывает на принадлежность: «сын Кыркуна» или «из рода Кыркуновых». Фамилия образована уже на русской почве, когда тюркское прозвище или имя Кыркун оформили по русской модели.

Географически Кыркуновы встречаются в основном в Поволжье и на Урале — в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской области. Это регионы, где веками жили вместе тюркские и русские народы, и фамилии такого типа — естественный результат смешения культур.

Редкость фамилии (вряд ли больше нескольких сотен носителей) говорит о том, что род, скорее всего, не был многочисленным, а прозвище не превратилось в массовое. В дореволюционных переписях Кыркуновы могли быть и крестьянами, и мещанами — сословная принадлежность по одной фамилии не определяется, но тюркская основа не даёт оснований считать их дворянами.

В написании стоит запомнить: через «ы», а не «и» — «Кыркунов», а не «Киркунов». Это сохраняет тюркское произношение, где звук «ы» твёрдый и короткий.