Фамилия Лачугова — женская форма фамилии Лачугов, и её происхождение связано с прозвищем, которое могло звучать как Лачуг. В основе лежит слово «лачуга» — убогое, ветхое жилище, маленькая и бедная хижина. Слово это известно в русских говорах с XVII века и имеет экспрессивную, часто пренебрежительную окраску. Фамилия образована по самой распространённой модели — с помощью суффикса -ов, который указывает на принадлежность: «сын (или потомок) Лачуга».

Скорее всего, прозвище Лачуг дали человеку, который жил в плохой, тесной избе или в землянке. В крестьянской среде такое прозвище могло быть не столько насмешкой, сколько бытовой характеристикой — указанием на бедность или неустроенность. Однако не стоит исключать ироничный подтекст: прозвище мог заслужить человек, который, наоборот, имел большой дом, но пренебрежительно называл его «лачугой». В русской ономастике известны случаи, когда прозвища давались «от противного», с намёком.

Слово «лачуга» не имеет чёткого книжного происхождения; в словаре В. И. Даля оно отмечено как южное и западное, с вариантами «лачук», «лачужка». Это указывает на возможную географию фамилии: она могла возникнуть в южнорусских или западнорусских регионах, где слово бытовало активнее. Фамилия Лачугов встречается реже, чем, например, Лачужников (от «лачужник» — владелец лачуги), что делает её более редкой и локальной.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Лачугин, Лачужкин — показывает, что основой служило именно прозвище, а не топоним. Если бы фамилия происходила от названия деревни Лачуги (такие населённые пункты есть, но они единичны), то форма была бы, скорее всего, Лачугский или Лачужский. Таким образом, версия с прозвищем более правдоподобна.