Фамилия Ларкин образована от краткой формы крестильного имени Илларион. В просторечии Иллариона звали Ларкой — так имя сократили и переделали на русский лад. Греческое слово hilarios, от которого произошло церковное имя, означает «веселый». Значит, в основе фамилии лежит характеристика предка, данная ему при крещении, а не прозвище.

Существует и другая версия — скандинавская. Шведское larka переводится как «жаворонок». Согласно этой гипотезе, Ларкой могли прозвать человека, который вставал ни свет ни заря. Однако эта версия кажется надуманной. Во-первых, шведское влияние на русские фамилии минимально, а во-вторых, у фамилии есть очевидное и простое объяснение через церковное имя. Модель образования через суффикс -ин указывает на принадлежность: Ларкин — «сын Ларки» или «человек из семьи Ларки». Такая модель типична для русских фамилий от имен и прозвищ, оканчивающихся на -а, -я.

Интересно, что фамилия Ларкин встречается не только в России. В англоязычном мире она тоже существует, но там её корень иной — от имени Ларкин, уменьшительной формы Лоренса. Русский и английский Ларкины — это разные фамилии, которые случайно совпали по звучанию.