Фамилия Ларкина образована от имени Ларка — краткой формы крестильного мужского имени Илларион. Илларион происходит от греческого слова hilarios, что значит «веселый». Такая модель, когда фамилии на -ин возникали от прозвищ или уменьшительных форм крестильных имён, — одна из самых распространённых в русской ономастике. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Ларкин, то есть сын или потомок Ларки.

Скорее всего, основатель рода Ларкиных был выходцем из рабочей или крестьянской среды. Фамилии с основой на -а и суффиксом -ин в массе своей закрепились именно в простонародье, где сокращённые имена (Ларка, Мишка, Петька) были повседневными и естественными. В дворянской среде такие фамилии встречаются значительно реже.

Существует также гипотеза, связывающая фамилию со шведским словом larka — «жаворонок». Она малоправдоподобна: массового шведского влияния на русский быт, особенно в крестьянской среде, не было, а фамилии от иноязычных прозвищ в центральной России — редкость. К тому же имя Ларка как производное от Иллариона хорошо документировано в русских писцовых книгах и святцах.

Таким образом, потомок человека по имени Ларка со временем получил фамилию Ларкина. Эта фамилия — не про птицу, а про весёлого предка, которого в быту звали сокращённо, по-свойски.