Фамилия Латифуллин — классический пример того, как тюркское имя превратилось в русскую фамилию с помощью суффикса принадлежности. Основа здесь — арабское мужское имя Латифулла, которое в переводе означает «благость Аллаха» или «доброта Божья» (от арабского «латиф» — добрый, мягкий, и «Аллах»). Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Латифуллин, то есть потомок человека по имени Латифулла.

Модель образования типична для татарских и башкирских фамилий, которые складывались в XIX веке, когда после переписи населения мусульманам Волго-Уралья начали массово присваивать фамилии по отцу. Если отца звали Латифулла, его сыновья и внуки автоматически становились Латифуллиными. Интересно, что в самой основе сохранился полный теофорный элемент («улла»), что бывает реже, чем усечённые варианты вроде Латипов (от Латиф) или Латифов.

Географически фамилия гуще всего встречается в Татарстане, Башкортостане и среди татарской диаспоры в Оренбургской, Челябинской, Ульяновской областях. Встречается и у казахов, но там чаще пишется как Латифулы или Латипұлы, без русского фамильного суффикса.

В русском языке фамилия склоняется как обычное прилагательное: Латифуллин, Латифуллина, Латифуллину. Ударение, как правило, падает на третий слог — на «у»: Латифу́ллин. Вариант с двойным «л» (Латифуллин) закрепился в орфографии, хотя в арабской графике там одна буква «лам» — это влияние русского письма, где суффикс -ин требует двойной согласной в основе на -л (сравните: Габдуллин, Ибрагимов — но Ибрагимов, потому что основа на -м).

Если коротко: Латифуллин — это «сын Латифуллы», а сам Латифулла — человек, чьё имя напоминало о божественной доброте. Никакой тайны, только чёткая родословная метка.