Фамилия Латохин — яркий пример русского типа фамилий на -ин, образованных от прозвищ или мирских имён, оканчивающихся на -а/-я. Вопреки распространённому мнению, такие фамилии не обязательно указывают на принадлежность матери (как в случае с «мамиными» фамилиями вроде Машин). Суффикс -ин в данном случае работает стандартно: присоединяется к основе, оканчивающейся на гласный, и означает «чей-то», «сын кого-то» или «потомок такого-то человека».

В основе фамилии лежит прозвище Латоха. Его происхождение запутаннее, чем кажется. Самая очевидная версия — связь с диалектным глаголом «латать», то есть чинить, ставить заплаты. Латохой могли назвать портного, который постоянно что-то штопает, или просто бедно одетого человека, чья одежда вся в латках. Однако в северных и сибирских говорах у слова «латоха» было и другое значение — «неповоротливый, вялый человек». Прозвище могло закрепиться за медлительным, флегматичным крестьянином.

Менее вероятная, но любопытная версия выводит Латоху из уменьшительной формы редкого крестильного имени Галактион (от греч. «молоко, млечный»). В народе это имя сильно искажалось: Лактион, Латоня, Латоха. Если это так, то фамилия Латохин — отголосок церковного имени, почти полностью утратившего свою первоначальную форму.

Географически фамилия тяготеет к центральным и южным регионам России, но особенно плотно встречается в Воронежской области и на Среднем Дону. Это неудивительно: именно в чернозёмных губерниях было много крестьян-портных и шорников, чьё прозвище легко становилось наследственным.

Интересно, что фамилия Латохин избежала путаницы с более известной фамилией Латонов (от греческого «латон» — «скрытый»). Фонетически они близки, но словообразовательные модели разные: Латонов — это фамилия семинарского происхождения, искусственная, а Латохин — чисто бытовая, народная. Если предок носителя был грамотным и служил в церкви, он бы носил фамилию Латонов, а не Латохин.