Фамилия Лаутина — редкий пример русской фамилии, в основе которой лежит не славянский, а прибалтийско-финский корень. Скорее всего, её образовали от прозвища Лаута, а оно, в свою очередь, восходит либо к финскому слову lauta («доска»), либо к глаголу lautata («перевозить»). Отсюда и две основные версии о том, кем был первый носитель прозвища.

По первой версии, Лаутой могли назвать очень худого, высокого человека — «доскообразного», как говорили в народе. По второй — прозвище давали по роду занятий: плотнику (работающему с досками) или лодочнику, извозчику (тому, кто перевозит грузы). Есть и третья, эстонская версия: в эстонском языке слово lauta означает «хлев», так что прозвище мог получить скотовод или владелец хозяйственного двора.

Суффикс -ин указывает на то, что фамилию дали по отцу: «сын Лауты». Такая модель образования типична для северных и центральных областей России, где чаще всего и селились выходцы из финно-угорских земель. Фамилия Лаутина — штучная, не массовая, и её носители, вероятно, происходят из мест, где русские и прибалтийские народы веками жили рядом: Карелия, Ингерманландия, Псковщина.