Фамилия Лепахин образована от прозвища Лепаха. Оно восходит к украинскому слову «леп» - «грязь», «земляной воск». Скорее всего, Лепахой называли нечистоплотного человека, либо того, кто выполнял «грязную» работу. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Лепаха, со временем получил фамилию Лепахин.