Фамилия Лепеев образована от прозвища Лепей, которое восходит к глаголу «лепить». Так, предок обладателя фамилии Лепеев мог заниматься гончарным делом или изготовлением мазанок (домов из глины, сырцового кирпича или дерева, обмазанного глиной). Иногда Лепеем называли и того, кто все делал излишне поспешно. Так и прозвище Лепей закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Лепеев. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Лепей, со временем получил фамилию Лепеев.