Фамилия Левонтин стоит особняком даже среди еврейских фамилий с их богатой традицией аббревиатур и формантов. Если фамилии вроде Кац или Шац — это прямые сокращения библейских и религиозных титулов (коэн цэдэк, шалиах цибур), то Левонтин — аббревиатура иного рода, указывающая на происхождение из конкретного местечка. Основа фамилии — ивритское словосочетание «Лев Онтен», где «Лев» означает «сердце», а «Онтен» — это топоним, название деревни или городка. Буквально — «сердце (то есть центр или лучшая часть) Онтена». Онтен — это, скорее всего, искажённое название литовского города Аникщяй (Anykščiai), который в еврейской традиции назывался Онтэн или Антон.

Таким образом, Левонтин — это не просто фамилия-аббревиатура, а фамилия-топоним, свёрнутая в акроним. Носитель такой фамилии — потомок выходца из местечка Онтэн, которого когда-то прозвали «Лев Онтен» — «сердце Онтена», возможно, за особые заслуги или просто для отличия от других переселенцев. В XIX веке, когда начался массовый процесс присвоения фамилий евреям Российской империи, это прозвище и закрепилось как наследственная фамилия. По модели образования она близка к таким фамилиям, как Левентон или Левенталь, где в основе также лежит корень «лев» (сердце) и название места.

Встречается эта фамилия преимущественно у евреев — выходцев из Литвы и Беларуси (так называемых литваков). Ашкеназский суффикс -ин здесь не является русским патронимическим окончанием (как в Иванов или Пушкин), а служит просто грамматическим оформлением, приспособлением ивритской основы к славянской модели склонения. Поэтому Левонтин — не «сын Левона», а «тот, кто из Онтена». Среди известных носителей — израильский поэт и писатель Иехуда Левонтин, чья фамилия прямо отсылает к этой географической аббревиатуре.