Фамилия Либанов — это отчество второго порядка, то есть «внучий» патроним: Либанов — сын Либана, внук Либы. Суффикс -ан здесь указывает на украинское или румынское происхождение основы. Документы подтверждают, что фамилию Либан носят жители Украины и Румынии (исторической Бессарабии), что делает эту версию основной.

Корень фамилии, скорее всего, восходит к еврейскому женскому имени Либа. Оно означает «приятная», «любимая» и связано с идишским словом «либ» — «милый», «ценный». Таким образом, фамилия Либанов могла образоваться от имени матери или бабушки, что было распространено в еврейской среде.

Есть и альтернативная гипотеза: Либанов — фонетический вариант фамилии Любанов. В этом случае в основе лежит славянское мирское имя Любан, которое тоже означает «любимый», «милый». Переход «ю» в «и» мог произойти под влиянием акающих говоров или при записи фамилии чиновником. Однако первая версия — с еврейским женским именем — выглядит правдоподобнее, учитывая географию бытования фамилии и типичную для западных регионов словообразовательную модель.