Фамилия Лисеенко — яркий пример украинской модели фамильного имени, образованной с помощью суффикса -енко, который в XVI–XVII веках был самым распространённым способом назвать сына по отцу. Буквально Лисеенко — «чей?» — «Лисей» + «-енко» означает «сын Лисея», «маленький Лисей» или «потомок Лисея». Сейчас это одна из самых узнаваемых фамилий на востоке Украины и юге России, но её основа — прозвище Лисей — таит в себе сразу несколько возможных значений.

Первая и самая очевидная версия связывает прозвище Лисей с украинским словом «лисеня» — «лисёнок». В древности, давая младенцу прозвище по животному, родители верили, что природа примет ребёнка как своего, а к нему перейдут полезные качества: хитрость, ловкость, осторожность. Такие имена-обереги были распространены у славян задолго до появления фамилий.

Однако есть и другая, не менее убедительная версия. В украинском языке «лисий» означает «лысый». В этом случае прозвище Лисей могло отражать чисто внешнюю черту — отсутствие волос на голове у основателя рода. В старину к лысым относились с уважением: считалось, что лысина — признак жизненного опыта и мудрости. Недаром говорили: «Детинка с плешинкой везде пригодится». Так что Лисеем могли назвать не просто лысого, а бывалого, зрелого человека.

Интересно, что прозвище Лисей могло возникнуть и в среде охотников или лесников — как указание на связь с лесом и повадками зверя. Однако это уже домысел: никаких документальных подтверждений, что предки Лисеенко жили именно у леса, нет.

Словообразовательная модель фамилии проста: суффикс -енко указывает на украинское происхождение и патронимический характер (отчество в форме притяжательного прилагательного). Со временем прозвище Лисей полностью вытеснило крестильное имя предка и закрепилось в документах уже как наследственное — сначала для сына, а затем и для всех потомков. В русском языке фамилия закрепилась в форме Лисеенко, хотя в украинских говорах встречается и вариант Лисенко (через одно «е»).