Фамилия Лисенкин — одна из тех, где внешняя прозрачность обманчива. Кажется, что корень «лис» указывает на животное, но в русских фамилиях прямое зоологическое прозвище «Лис» встречается реже, чем производные от уменьшительных форм крестильных имён. И Лисенкин — как раз такой случай.

В основе фамилии лежит, скорее всего, не лиса, а каноническое имя Лисей (разговорная форма от Елисей) или его производное Лисеня. Суффикс -енк- в русских фамилиях указывает на уменьшительно-ласкательную форму: Лисеня — это «маленький Лисей» или «сын Лиса». А окончание -ин — классический притяжательный суффикс, отвечающий на вопрос «чей?». Таким образом, Лисенкин буквально означает «сын Лисенки», то есть внук или потомок человека по прозвищу Лисеня.

Менее вероятная, но возможная версия — происхождение от мирского прозвища Лисёнок. В старину так могли назвать хитрого, льстивого или рыжеволосого человека. Однако в этом случае мы бы ожидали фамилию Лисёнков или Лисёнкин (с буквой ё), а форма Лисенкин с буквой е под ударением чаще фиксируется в документах именно как производная от имени. В говорах северных и центральных губерний России имя Лисей было вполне употребительным, и именно там фамилия Лисенкин встречается чаще всего — в старых переписях Вологодской, Костромской и Вятской губерний.

Словообразовательная модель здесь та же, что и в фамилиях Денискин (от Денис), Федосеенкин (от Федосей), Микешкин (от Микей) — все они построены по схеме: разговорная форма имени + суффикс -енк- + -ин. Это не дворянская фамилия, а типичная крестьянская или мещанская, образованная в XVI–XVII веках, когда в России окончательно закрепилась традиция передавать отчество в виде фамилии по мужской линии.

Так что, если вы Лисенкин, ваши предки с большой вероятностью носили имя Елисей или его народный вариант Лисей. А связь с лисой — лишь случайное созвучие, которое, впрочем, народная этимология могла переосмыслить уже после закрепления фамилии.