Основой фамилии Лисунов послужило мирское имя Лисун. Мирское имя Лисун восходит к названию животного - «лиса». Давая младенцу такие имена, как, например, Лисун, родители хотели, чтобы природа воспринимала ребёнка как своего, чтобы к нему перешли те полезные качества, которыми наделён избранный представитель животного или растительного мира. Поскольку издревле лисица считалась символом коварства и вероломства, то Лисуном могли называть и человека хитрого, льстивого. Об этих качествах лисы сложено немало поговорок и пословиц: «Лиса и во сне кур у мужика в хлеве считает!», «У лисы и во сне ушки — на макушке!», «Где я лисой пройдусь, там три года куры не несутся!», «Кто попал в чин лисой, будет в чине — волком!», «Когда ищешь лису впереди, она — позади!», «Лиса все хвостом покроет!» Согласно другой, менее правдоподобной версии, фамилия Лисунов образована от прозвища Лисун, которое восходит к прилагательному «лысый» (в некоторых говорах прилагательное «лысый» звучало как «лисый»). Однако Лисуном также могли называть опытного, бывалого человека. В некоторых говорах слово «лисый» означало «жёлтый». Таким образом, прозвище Лисун мог получить человек со светло-рыжими волосами.