Фамилия Лобакина образована от мужской формы Лобакин — а это типичная «фамилия-отчество» на -ин, где суффикс указывает на принадлежность: «чей?» — Лобакин, то есть сын или потомок Лобаки. Основа здесь — прозвище Лобак, которое, в свою очередь, напрямую связано со словом «лоб». В старину лобаком могли назвать человека с большим, выпуклым или широким лбом, либо того, кто отличался упрямством — в народе говорили «лобастый» об упрямце. Похожий прозвищный ряд дал фамилии Лобанов, Лобов, Лобастый.

Интересно, что слово «лоб» в древнерусском языке имело и более широкое значение — так называли крутой берег, холм или возвышенность. Поэтому не исключено, что прозвище Лобак могло относиться к человеку, жившему на видном возвышенном месте или владевшему таким участком земли. В говорах северных и центральных губерний России встречалось и слово «лобака» — так называли большую рыбу с широкой головой, например, головля. Рыбак с таким уловом или сам рыбак-ловкач тоже мог получить подобное прозвище.

Суффикс -ин в фамилии Лобакин — один из самых распространённых в русской ономастике, особенно на севере и в Поволжье. Он образовывал фамилии от основ на -а, -я, что и произошло здесь: Лобак — Лобакин. В документах XVIII–XIX веков встречаются крестьяне и мещане с фамилией Лобакины в Вятской, Пермской и Костромской губерниях. Именно в этих регионах прозвища, связанные с внешностью, были особенно живучи и часто переходили в фамилии без изменений.

С точки зрения словообразования, фамилия Лобакина стоит в одном ряду с такими как Косакин (от косак — косой человек), Губакин (от губак — толстогубый) или Носакин. Все они указывают на яркую внешнюю черту предка, которая бросалась в глаза окружающим и закреплялась в родовом имени. Таким образом, первый носитель фамилии Лобакин был, скорее всего, заметным человеком — либо физически, либо характером.