Фамилия Лобунцов образована от прозвища или мирского имени Лобунец. В основе лежит слово «лоб» — в старину так могли назвать человека с большим, выпуклым или высоким лбом, либо того, кто отличался упрямством («лобастый»). Суффикс -ун- в прозвище Лобун встречается в русских именованиях довольно часто (ср. Борун, Говорун, Хвастун) и придаёт слову оттенок характерного признака: Лобунец — тот, кто приметен своим лбом. Фамилия принадлежит к распространённому типу на -ов, указывающему на принадлежность: «чей?» — Лобунцов, то есть сын или потомок Лобунца.

По другой версии, Лобунец могло быть не прозвищем, а уменьшительной формой христианского имени. В народе нередко переиначивали календарные имена на свой лад: так, от Варлаам или Лавр могли возникнуть просторечные варианты, созвучные слову «лоб». Однако эта гипотеза менее убедительна: корень лоб- в славянских прозвищах встречается часто (фамилии Лобов, Лобанов, Лобачёв), и естественнее видеть здесь прямое указание на внешность или характер.

Модель образования фамилии — прозвище на -ец + патронимический суффикс -ов — характерна для русского Севера и центральных областей. В писцовых книгах и переписях XVI–XVII веков подобные именования фиксируются в Новгородской, Вологодской и Вятской землях. Так что географически предки Лобунцовых, скорее всего, были выходцами из этих регионов. В сословном плане носители фамилии могли быть как крестьянами, так и посадскими людьми — фамилия не указывает на дворянское происхождение, но и не говорит о низком статусе.

Редкий суффикс -унц- в основе (Лоб-ун-ец) отличает эту фамилию от более частых Лобова или Лобанова. Если Лобанов — от «лобан» (большелобый), то Лобунец — более экспрессивное, «говорящее» прозвище, подчёркивающее яркую особенность человека. В современных говорах слово «лобунец» не сохранилось, но его смысл легко восстанавливается через однокоренные «лобастый», «лбучий» (упрямый).

Таким образом, фамилия Лобунцов — типичное русское родовое именование, возникшее из прозвища по внешней примете или характеру. Она несёт в себе живую черту далёкого предка, которого окружающие запомнили по его «лбу» — будь то физическая особенность или упрямый нрав.