Фамилия Лоновенко — типичный пример украинской модели образования фамилий на -енко. Этот суффикс, один из самых распространённых в Украине, изначально означал «сын» или «потомок» (как русское -ович). Таким образом, Лоновенко — это буквально «сын Лоны», то есть человека, носившего прозвище Лона. В основе фамилии лежит не крестильное имя, а прозвище, и здесь у исследователей есть несколько версий, каждая из которых по-своему объясняет, кем мог быть первый Лона.

Первая версия связывает прозвище с украинским словом «лона» — «зарево», отсвет пожара или огней заката. Такое прозвище могли дать человеку, чей дом стоял на видном месте и был заметен издалека, или, напротив, погорельцу — тому, кто пережил пожар. Вторая версия отталкивается от общеславянского слова «лоно» (грудь, чрево, символ материнской нежности). В этом случае Лоной могли в шутку или с лаской назвать «маменькиного сынка», ребёнка, сильно привязанного к матери.

Третья, более редкая и неожиданная версия, выводит прозвище от слова «лонь» — одного из старых названий саамов (лопарей). По мнению этнографов, это название шведского происхождения и означает «край», «предел», то есть «человек с края земли». Если эта гипотеза верна, то прозвище Лона могло указывать на этническое происхождение предка или на его внешнее сходство с представителями этого северного народа. Впрочем, для южнорусских и украинских земель, где фамилия Лоновенко встречается чаще всего, эта версия выглядит менее вероятной, чем первые две, основанные на местной лексике.

Итак, перед нами прозвище в чистом виде, ставшее фамилией. Суффикс -енко однозначно указывает на украинское происхождение, а само прозвище Лона, скорее всего, было дано по яркой внешней примете (зарево, вид из дома) или по особенности характера.