Фамилия Лопушкова образована от прозвища Лопушок. В её основе лежит слово «лопух» — широко распространённое растение с большими листьями. Однако прозвище это, скорее всего, не ботаническое, а бытовое и переносное.

На первый взгляд, Лопушком могли назвать простоватого, доверчивого человека, которого легко обвести вокруг пальца. В народной речи «лопух» до сих пор означает простака. Но у этого прозвища есть и другой, противоположный смысл. Лопушком нередко называли весёлого и находчивого человека, который сам никому не даст себя в обиду. Такая двойственность вообще свойственна русским прозвищам: одно и то же слово могло закрепиться и как насмешка, и как уважительное признание смекалки.

Есть и третья, менее очевидная версия. Лопушок — это прозвище знахаря или травника. Лопух издавна использовали в народной медицине, и человека, который ходил по лесам и собирал целебные травы, могли прозвать по самому заметному растению в его корзине. Не исключено, что прозвище Лопушок давали и больному — как намёк на то, что он нуждается в лечении лопухом.

Фамилия Лопушкова образована по типичной русской модели: к основе на -ок прибавился патронимический суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Лопушка). Форма Лопушкова — это женская или притяжательная форма от мужской фамилии Лопушков. Такие фамилии распространены в северных и центральных регионах России, где суффикс -ов встречается чаще, чем в южных землях, где предпочитали -енко или -ук.

Таким образом, предок современных Лопушковых мог быть и деревенским простаком, и ловким парнем, и травником-лекарем. Точное значение прозвища теперь не восстановить — оно зависело от того, кто и за что окрестил человека Лопушком.