Фамилия Лоскутников образована от прозвища Лоскутник. В основе лежит слово «лоскут» — отрывок, отрезок ткани или кожи. Прозвище давали человеку по роду занятий или по внешнему виду: лоскутником называли того, кто торговал лоскутами, собирал их или сам одевался в обноски. Такая фамилия не просто указывает на ремесло, но и может говорить о невысоком социальном положении предка.

Модель образования типична для русских фамилий: суффикс -ник указывает на лицо по действию или предмету (ср. сапожник, плотник), а затем прибавился фамильный суффикс -ов. То есть сначала было прозвище Лоскутник, а его потомки стали Лоскутниковыми. Фамилия эта не из самых частых, но имеет глубокие корни.

Однокоренные фамилии встречаются в исторических документах. В словаре С. Б. Веселовского записаны: Иван Лоскут, крестьянин (1579 г., Шуя); Лоскут, пушкарь (1638 г., Рязань); Иван Алексеевич Лоскутов (1596 г., Белев). Эти записи показывают, что прозвище Лоскут и его производные бытовали в разных слоях общества — от крестьян до служилых людей. Пушкарь Лоскут, например, явно не был тряпичником; возможно, прозвище он получил за какую-то особенность внешности или одежды.

Интересна и сама основа: слово «лоскут» имеет общеславянские корни и родственно, например, украинскому «лоскут» и польскому «łoskot» (лоскут, отрывок). В русских говорах у слова были и переносные значения: так могли назвать неряшливого или бедного человека, чья одежда напоминала лохмотья. Поэтому фамилия Лоскутников могла закрепиться и за тем, кто не торговал, а просто ходил в рваном платье.

Регионально фамилия чаще встречается в центральных и северных областях России — там, где были развиты текстильные промыслы и торговля тканью. Встречается и в Сибири, куда переселенцы принесли её в XVII–XVIII веках. Вариантов написания немного: Лоскутников — самая распространённая форма, реже встречается Лоскутниковъ (до реформы орфографии). Ударение обычно падает на второй слог: Лоску́тников.