Фамилия Лотоп — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В отличие от типичных русских фамилий на -ов, -ин или -ский, она имеет усечённую форму и не даёт сразу понять, от какого слова образована. Здесь возможны две основные версии, и обе заслуживают внимания.

Первая и наиболее вероятная версия — фонетическое искажение и усечение фамилии Лотопов. В русских говорах, особенно в северных и сибирских, фамилии на -ов нередко теряли окончание в обиходной речи: Лотопов превращался в Лотопа, а затем в Лотоп. Такое «отпадение» суффикса встречается в фамилиях, записанных со слов носителей или в документах с ошибками писцов. Если это так, то основа Лотоп- восходит к прозвищу Лотоп, которое могло быть связано с глаголом «лопотать» — говорить невнятно, быстро, бормотать. В старину лопотливым называли болтливого или торопливого в речи человека. Сравните с фамилиями Лопотов, Лопотков — они существуют и фиксируются в ономастических справочниках.

Вторая версия, более экзотическая, предполагает, что Лотоп — это вариант фамилии Лотопов, образованной от названия профессии. В некоторых говорах «лотоп» или «лотопник» могли называть того, кто занимался лотками — мелкой торговлей или изготовлением деревянных лотков. Однако эта гипотеза слабее: слово «лотоп» в значении «торговец с лотка» в русских диалектах почти не зафиксировано, и большинство словарей его не знают. Поэтому версия с прозвищем от «лопотать» выглядит убедительнее.

Географически фамилия Лотоп встречается крайне редко, в основном в центральных и северных областях России. Её редкость — дополнительный аргумент в пользу того, что она возникла как сокращение более распространённой формы. Если ваши предки носили фамилию Лотоп, скорее всего, в более ранних записях она могла выглядеть как Лотопов, и корень её — живая черта характера или речи далёкого родоначальника.