Фамилия Лунковская — женская форма от Лунковский, и её разумнее всего разбирать именно в мужском варианте, так как модель образования типична для польско-украинско-белорусского пограничья. Суффикс -ск- указывает на дворянское или шляхетское происхождение, но не гарантирует его: в XIX веке такие фамилии активно давали и крестьянам при переписях, особенно в западных губерниях Российской империи. Основа — Лунков, то есть притяжательное прилагательное от прозвища или имени Лунко.

Что такое Лунко? Здесь возможны два пути, и оба реальны. Первый: уменьшительная форма от канонического имени Лонгин (в просторечии Лун, Лунь). Второй, более вероятный для восточнославянской среды, — прозвище от слова «лунь». Лунь — это хищная птица, похожая на ястреба, но с характерной белесой, «седой» окраской оперения у самцов. Отсюда в русских говорах «лунь» — о человеке с совершенно седыми волосами. Прозвище Лунь или уменьшительное Лунко дали бы такому человеку: «белый, как лунь». Фамилия Лунковский, следовательно, — «сын или потомок Лунка». Географически фамилия тяготеет к западу: наибольшая плотность носителей Лунковских фиксируется на территории современной Беларуси (Гродненская, Минская области) и в приграничных районах Польши. Встречается она и на Украине, но реже.

Спорный момент — возможная связь с топонимом Лунково или Лунков. Таких деревень и хуторов несколько в Беларуси и на Смоленщине. Если предок получил фамилию по названию поместья или места жительства, то перед нами типичная «топографическая» фамилия. Но здесь работает правило бритвы Оккама: прозвищная версия проще и не требует допущения, что все Лунковские — выходцы из одной деревни. Скорее всего, фамилия образована от прозвища, а уже потом могла совпасть с названием поселения. В любом случае, носитель фамилии Лунковская может с равным правом считать себя потомком либо «седого» человека, либо человека, жившего на земле с таким названием.