Фамилия Лупекин образована от прозвища Лупека. По одной из версий, оно происходит от диалектного украинского нарицательного «лупак» - «сланец» (горная порода, характеризующаяся слоистым строением, способностью расслаиваться). Вероятно, прозвище содержало указание либо на род занятий основателя фамилии (горнодобытчик), либо на особенности места его жительства (недалеко от залежей сланца). Возможно также, что основой для прозвища послужило украинское «лупеха» - «отрезок дерева, из которого изготовляют трубку». В таком случае прозвище Лупека мог получить плотник. Наконец, нельзя исключить, что родоначальник Лупекиных был выходцем из деревни Лупеки, которая находится в Унечском районе Брянской области. Так, в Книге памяти Омской области записан Лупекин Андрей Аксенович, который родился в 1883 году в Могилевской губернии. А из архивов УВД Томской области известен Лупекин Егор Степанович, рожденный в 1876 году.