Фамилия Лялюшкин — редкий пример, где прозвищная основа и суффикс сложились в почти что ласкательное слово. В центре фамилии лежит имя или прозвище Лялюшка. Скорее всего, это производное от древнерусского нецерковного имени Ляля. В диалектах и в древнерусском языке «ляля» означало дитя, младенца, а также могло быть обращением к маленькому ребенку — нечто вроде современного «лялька». В некоторых говорах слово «ляля» или «лялюшка» употребляли как ласковое прозвище для младшего в семье, для малыша, которого баловали. Человек с таким прозвищем, вероятно, был младшим сыном, самым маленьким ростом или просто отличался детской внешностью.

Модель образования типична для восточнославянских фамилий: суффикс -ин указывает на принадлежность. Лялюшкин — «чей?» — сын Лялюшки. Интересно, что суффикс -ушк- в основе (Лялюшк-) обычно придает слову уменьшительно-ласкательный оттенок, и в фамилии он сохранил этот оттенок. В отличие, скажем, от фамилии Лялин, где основа короче и суше, Лялюшкин звучит мягче, как будто прозвище давали не просто «ляле», а «лялюшке» — подчеркнуто нежно. Это редкий случай, когда фамилия прямо передает эмоциональную окраску прозвища.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным областям России. Встречается в Вологодской, Костромской, Нижегородской губерниях, единичные записи есть в Архангельской. В XIX веке Лялюшкины — преимущественно крестьяне и мещане. В списках однодворцев эта фамилия не фиксируется, что косвенно указывает на ее позднее закрепление в крестьянской среде после отмены крепостного права, когда многие прозвища стали фамилиями.

Ошибочно связывать фамилию с тюркскими корнями. Хотя в татарском есть слово «ләлә» (тюльпан), оно не имеет отношения к русскому прозвищу. Славянская основа «ляля» — детский лепет, общеславянское слово, которое встречается у всех восточных славян. Поэтому версия о происхождении от имени Ляля остается основной и наиболее убедительной. Других правдоподобных этимологий у фамилии нет.