Фамилия Лысачкина — женская форма фамилии Лысачкин. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Лысачко. Чтобы понять его происхождение, нужно разобрать словообразовательную цепочку, и здесь есть два равноправных пути.

Первый: Лысачко — это человек с заметной лысиной, то есть лысый. В русских говорах слово «лысач» или «лысачок» могло означать не просто лысого, но и, в переносном смысле, хитрого, себе на уме человека (лысина ассоциировалась с опытностью и хитростью). Уменьшительно-уничижительный суффикс -к-о (Лысач-к-о) придавал прозвищу бытовой, фамильярный оттенок — так могли назвать в семье или в деревне.

Второй: Лысачко — это производное от имени Лысак или Лысан, которые на Руси давали детям не в насмешку, а как оберег. Считалось, что имя, указывающее на физический недостаток (лысина, хромота, кривизна), отпугнёт злых духов и сделает ребёнка здоровым. Со временем прозвище закрепилось за родом, а суффикс -ин образовал притяжательную фамилию: «чей?» — Лысачкин, то есть сын, внук или слуга Лысачка.

Фамилия довольно редкая. Её географическое ядро — центральные и южные области России, особенно Курская, Белгородская и Воронежская области, где распространены фамилии на -кин, -чин, -чкин. Встречается она и на Украине, в форме Лисачко или Лысачко, что указывает на общие корни в диалектной среде.

С точки зрения социальной истории, Лысачкины — это, скорее всего, потомки крестьян или однодворцев (государственных крестьян, живших на южных рубежах). Сословные перегородки в России были жёсткими, и фамилии с прозвищной основой, без дворянских суффиксов (-ский, -ич), редко поднимались выше мещанства. Исключения возможны, но маловероятны — фамилия не фиксируется в родословных книгах дворянства.

В современном написании фамилия Лысачкина сохраняет все буквы исходного прозвища. Вариант через «и» (Лисачкина) — результат аканья или украинского влияния, но в русской орфографии закрепился именно «ы».