Фамилия Любутины образована по типичной восточнославянской модели с суффиксом -ин. Этот суффикс указывал на принадлежность: «чей?» — «любутин», то есть сын, потомок или человек из семьи Любуты. Основа фамилии — прозвище или нецерковное имя Любута. В древнерусском языке корень «люб-» связан с понятиями «любить», «милый», «дорогой». Имена и прозвища с этим корнем (Любим, Любава, Любомир) были широко распространены у славян. Любута, скорее всего, означало «любимый человек» или «тот, кого любят» — ласковое, уменьшительное прозвище.

Такие именования, образованные по той же модели, что и фамилия Любутин, широко представлены в ономастике восточных, западных и южных славян. Сам суффикс -ут(а) в основе (Люб-ут-а) встречается в древнерусских некалендарных именах и указывает скорее на народную, бытовую традицию имянаречения, чем на церковную. Это значит, что прозвище Любута могли дать ребёнку в семье, подчёркивая его желанность и любовь к нему.

Фамилия Любутин может по праву считаться ценным источником семейной истории: передаваясь из поколения в поколение, она по сей день хранит память о происхождении индивида. Однако процесс формирования каждой отдельной фамилии мог быть длительным и не всегда имел привязку только к одной местности. Поэтому окончательно говорить о точном времени и месте происхождения фамилии Любутин можно лишь на основании серьёзных генеалогических исследований.

Стоит добавить, что фамилия Любутин — самобытный памятник славянской культуры. В ней нет заимствованных корней или поздних искусственных элементов. Она целиком выросла из живого языка, из того, как люди называли друг друга в быту. По сути, предки современных Любутиных были людьми, которых в своём кругу называли ласково — «любутами», и это прозвище закрепилось за их родом.