Фамилия Люстина — довольно редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Чтобы понять её корни, нужно отбросить привычную модель «основа + суффикс -ин», которая в русском языке обычно указывает на принадлежность («чей?» — Люстин сын). В данном случае суффикс -ин, скорее всего, не отчественный, а структурный, и фамилия могла образоваться от прозвища или имени, которое уже заканчивалось на -а.

Самая вероятная версия связывает фамилию с немецким или западнославянским корнем. В основе лежит либо личное имя Люстин (Lustin), либо прозвище от слова «Lust» — в переводе с немецкого «радость», «удовольствие», «охота». Такое прозвище мог получить жизнерадостный, увлекающийся человек или, наоборот, тот, кто слыл «охотником» до чего-либо. В этом случае фамилия Люстина — это русифицированная форма немецкой фамилии Люстин (Lustin) или Люст (Lust) с добавлением окончания -а. Носители таких фамилий часто появлялись в России среди обрусевших немцев, прибалтийских немцев или через польское посредничество (польское «lust» означает то же самое).

Вторая, менее распространённая, но тоже возможная версия — топонимическая. Фамилия могла возникнуть от названия населённого пункта вроде Люстино или Люстин. Такие топонимы встречаются в западных регионах России и на Украине, где могли существовать хутора или деревни с похожим именем. Переселенцы из этих мест, переезжая в другие губернии, получали фамилию по месту прежнего жительства.

Третья, самая спорная гипотеза — связь с латинским словом «lustrum» (очищение, обновление) или «lustro» (озаряю, освещаю). В этом случае фамилия могла быть искусственной, семинарской, но для неё нет подтверждений в словарях — такие фамилии обычно оканчиваются на -ский (Люстринский), а не на -ин.

Социальный состав носителей фамилии Люстина — преимущественно мещанское и купеческое сословие. В XIX веке фамилия фиксируется в центральных губерниях России и в Поволжье, что косвенно подтверждает её «немецкий» след: немецкие колонисты активно селились именно там. Не стоит искать в фамилии славянского корня «люст» — такого слова в русском языке нет, все пути ведут в германские или польские говоры.