Фамилия Лыженко — яркий пример украинской модели фамилии, образованной с помощью суффикса -енко, что в переводе означает «маленький», «сын» или «потомок». В XVII–XVIII веках такие фамилии были особенно распространены на Левобережной Украине, в казацкой среде и среди крестьянства. Основа фамилии — прозвище Лыж(а) или Лыжко.

Самый вероятный корень — слово «лыжа» (приспособление для ходьбы по снегу). Прозвище Лыжа могли дать человеку с длинными ногами, неуклюжей походкой или, наоборот, быстрому и ловкому, как на лыжах. В русских говорах «лыжа» также могла означать «след» или «полоз», а в переносном смысле — «хитрец», «скользкий тип». Менее популярная версия связывает фамилию с диалектным глаголом «лыжить» — «шататься без дела», «лениться», тогда прозвище могло относиться к праздному человеку.

Учитывая ареал фамилии (Украина, южные регионы России, Беларусь), вариант с лыжами как обувью выглядит правдоподобнее: в этих краях снег бывал обильным, а лыжи — привычным средством передвижения. Суффикс -енко указывает на то, что предок носителя фамилии был сыном или потомком человека по прозвищу Лыжа. Таким образом, Лыженко — «сын Лыжи».

Встречается и польский след: в старопольском языке «łyżwa» означало «конёк», но это скорее редкое совпадение. Фамилия не относится к дворянским или купеческим — она бытовала в основном среди казаков и крестьян, что типично для модели на -енко. Сословной привязки у неё нет, но география указывает на украинское происхождение.